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CPMD

密度泛函平面波赝势代码，一款用于分子动力学从头计算的开源软件

ESPResSo

用途广泛的软件包，一个高度通用的，进行和分析粗粒度原子模型或珠簧模型的分子动力学软件包

MPQC

大型并行量子化学软件；支持密度泛函（DFT）

CP2K

一款著名的从头算分子动力学软件

TURBOMOLE

进行HF，DFT，MP2计算最快最稳定的代码之一

Octopus

一款赝势实空间软件包，用于含时电磁场下的一、二及三维有限系统的电子-离子动力学模拟

上海超算中心

曙光5000A，0.4Pflops，上海重要的信息技术基础设施

中科院超算中心

深腾7000，2.3Pflops(0.7CPU+1.6GPU)，元”超级计算系统

AMBER

著名的分子动力学软件，用于蛋白质、核酸、糖等生物大分子的计算模拟

Abinit

基于密度泛含理论，采用赝势和平面波基矢的方法来处理由电子和核所组成的体系

CASTEP

基于密度泛函方法的从头算量子力学程序，典型的应用表面化学，键结构，态密度和光学性质等

CHARMM

被广泛承认并应用的分子动力学模拟程序，用于生物大分子的模拟