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DL_POLY

一款通用的经典分子动力学软件，能方便地在分布式存储并行计算机上对大分子、聚合物、离子系统和溶液进行分子动力学模拟

Yambo

一款从头计算软件，在多体微扰论及含时密度泛函理论框架下计算电子系统的准粒子能量和光学性质

PSI4

一款开源的从头计算量子化学软件

WanT

用于模拟纳米结构的量子输运性质（电导），通过实空间的Wannier function来描述体系的哈密顿量

BerkeleyGW

可用于计算从周期性体相晶体到纳米结构多种材料（如二维平面、一维线和分子）的准粒子性质和光学响应

SIESTA

用于分子和固体的电子结构计算和分子动力学模拟

Multiwfn

能最全面、最易于使用、效率最高而且完全开源免费的波函数分析程序

ORCA

从头计算、DFT和半经验的从头电子结构SCF-MO程序包，可以处理环境的影响和相对论效应，特别着重于开壳层分子的光谱计算

XCrySDen

从头计算、DFT和半经验的从头电子结构SCF-MO程序包，可以处理环境的影响和相对论效应，特别着重于开壳层分子的光谱计算

OpenFOAM

一个针对不同的的流动编写不同的C++程序集合

Palobos

基于ＬＢＭ方法的计算流体软件，主要用于流体模拟

Code_Aster

结构力学数值模拟的免费软件，主要由EDF研发部门的“机械和声学分析”部门开发