能够实现比较两段核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能
用途广泛的软件包,一个高度通用的,进行和分析粗粒度原子模型或珠簧模型的分子动力学软件包
密度泛函平面波赝势代码,一款用于分子动力学从头计算的开源软件
从头计算量子化学程序。可以从RHF,ROHF,UHF,GVB和MCSCF计算波函,其中一些使用CI和MP2修正
一款通用的经典分子动力学软件,能方便地在分布式存储并行计算机上对大分子、聚合物、离子系统和溶液进行分子动力学模拟
一款著名的从头算分子动力学软件
使用标准量子力学方法描述电子波函数或密度,计算分子和周期性系统的特性,还可进行经典分子动力学和自由能模拟