超级计算

序列组装程序

通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能

用于研究生物分子体系的分子动力学程序包

一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具

可以拼接来自多个平台的测序数据

NCBI BLAST的免费开源并行实现。通过数据库碎片，查询分段，智能调度和并行I/O有效利用分布式计算资源，mpiBLAST将NCBI BLAST性能提高了几个数量级，同时扩展到数百个处理器。

准确度和强大的功能，能够整合很多信息,如结构信息,实验数据等用于序列比对

一个短序列的从头拼接软件

高效能的计算仿真工具, 工程师能够根据自行定义多种物理模型,应用於各种不同的工程领域

国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）系深圳市人民政府批准成立的企业化管理事业单位，属国家863计划、广东省和深圳市重大项目。主机系统2010年5月经世界超级计算机组织实测确认，运算速度达每秒1271万亿次，排名世界第二。

超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具

一款商业软件,但是如果只是科研用途的话,可以直接从其网站上下载到编译好的程序

设备仿真分析求解器，解决流体或固体流、传热和应力等相关问题的完整工程过程

CFD软件工具，可快速稳健地为各种CFD和多物理场应用提供可靠精确的解决方案

基于隐马尔可夫模型,用于生物序列分析工作的一个非常强大的软件包,它的一般用途是识别同源蛋白或核苷酸序列和进行序列比对

无缝集成于主流三维CAD软件中的高度工程化的通用流体传热分析软件

一款用于结构分析的有限元软件，适合固体、流体、传热等多领域问题，集成了前后处理和求解器

一款著名的从头算分子动力学软件

进行HF，DFT，MP2计算最快最稳定的代码之一

国际TOP500组织发布的，全球已安装的超级计算机系统排名

大型并行量子化学软件；支持密度泛函（DFT）

一个极为流行的宇宙学模拟程序

提供了独立的粒子型 Lattice Boltzmann 技术，可实现保真度计算流体动力学 (CFD) 方法

可用于计算从周期性体相晶体到纳米结构多种材料（如二维平面、一维线和分子）的准粒子性质和光学响应

曙光5000A，0.4Pflops，上海重要的信息技术基础设施

CFD 模块，定义和研究流体流动系统以及与其他物理现象耦合的流体流动系统

国家超级计算郑州中心

一款赝势实空间软件包，用于含时电磁场下的一、二及三维有限系统的电子-离子动力学模拟

半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件

基于密度泛含理论，采用赝势和平面波基矢的方法来处理由电子和核所组成的体系